ArcGIS Online の Map Viewer で選択色を変更できますか?

いいえ。 Map Viewer と Map Viewer Classic では、選択色をシアンから他の色に変更できません。 仕様により、選択色を構成できないようになっています。

代替策として、ArcGIS Web AppBuilder を使用して Web マップを作成し、Web マップで選択ウィジェットを構成します。 選択ウィジェットの選択色は変更可能です。 Web マップでウィジェットを構成する手順については、「ArcGIS Web AppBuilder: 選択ウィジェットの構成」をご参照ください。

ArcGIS Pro プロジェクトに適用されるアプリケーション設定として、ArcGIS Pro でも選択色を変更するオプションを使用できます。 詳細については、「ArcGIS Pro: 選択オプション」をご参照ください。